Giải trình tự bộ gen hoạt động như thế nào?
Giải trình tự bộ gen là thuật ngữ dùng để mô tả nhiều quy trình xét nghiệm khác nhau cung cấp thông tin chi tiết về cấu tạo di truyền của các tác nhân gây bệnh truyền nhiễm (vi trùng) khiến con người bị bệnh.
Bộ gen của các tác nhân gây bệnh được cấu thành từ DNA hoặc RNA. Cả DNA và RNA đều được hình thành từ các "khối xây dựng" gọi là nucleotide, cung cấp thông tin quan trọng về tác nhân gây bệnh. Quá trình đọc các nucleotide này trong phòng thí nghiệm bằng các công cụ tin sinh học được gọi là giải trình tự. Phân tích bộ gen của các tác nhân gây bệnh khác nhau cung cấp thêm thông tin về các vi khuẩn gây bệnh ở một cá nhân hoặc trong một quần thể. VDH sử dụng thông tin bộ gen để tìm kiếm các liên kết lây truyền tiềm ẩn trong quá trình điều tra bệnh tật trong y tế công cộng và xác định các nguồn phơi nhiễm phổ biến trong các đợt bùng phát dịch.
Kết quả giải trình tự bộ gen được sử dụng như thế nào?
- Phân tích và trực quan hóa dữ liệu bệnh tật. VDH có thể phân tích dữ liệu bùng phát dịch bệnh từ nhiều nguồn. Bao gồm thông tin trường hợp từ hệ thống giám sát bệnh tật và kết quả giải trình tự gen tác nhân gây bệnh. VDH tạo ra hình ảnh dữ liệu về kết quả bộ gen của tác nhân gây bệnh bằng cách sử dụng các công cụ phân tích như Microbetrace, Nextstrain, và Microreact. Các công cụ này cho phép chúng ta thấy cách bệnh tật lây lan thông qua sơ đồ mạng lưới lây truyền, bản đồ và cây phát sinh loài.
- Diễn giải báo cáo và truyền đạt kết quả. Chương trình Dịch tễ học bộ gen VDH giải thích kết quả bộ gen và phát triển các phương pháp giúp thông tin này dễ hiểu hơn.
- Thực hiện hành động vì sức khỏe cộng đồng. Chương trình Dịch tễ học Di truyền học phối hợp chặt chẽ với các chương trình bệnh truyền nhiễm kháctại VDH. Chúng tôi cùng nhau nỗ lực ngăn ngừa và kiểm soát các đợt bùng phát dịch bệnh ở Virginia.