Do mối quan hệ di truyền chặt chẽ giữa loài linh trưởng và con người nên các sinh vật gây bệnh có thể dễ dàng trao đổi giữa chúng. Các tác nhân gây bệnh có thể lây truyền từ động vật linh trưởng sang người và ngược lại bao gồm vi khuẩn, nấm, ký sinh trùng và vi-rút. Chúng có thể lây lan qua vết cắn, vết cào, tiếp xúc với động vật hoặc mô của chúng, lây truyền qua không khí qua các giọt bắn và khí dung, qua đường tiêu hóa và qua vật trung gian là động vật chân đốt. Thông thường, loài linh trưởng không phải người mang và truyền bệnh mà không có bất kỳ dấu hiệu nào có thể nhìn thấy được. Những người tiếp xúc với những loài động vật này phải luôn nhận thức được những rủi ro tiềm ẩn. Điều này đặc biệt đúng khi động vật bị căng thẳng, chẳng hạn như những con mới được vận chuyển hoặc đưa vào môi trường mới, hoặc mới mắc bệnh gần đây. Giống như nhiều bệnh truyền nhiễm khác, những người bị suy giảm miễn dịch có nguy cơ nhiễm trùng hoặc hậu quả nghiêm trọng do nhiễm trùng cao nhất.
Các loài linh trưởng không phải con người có thể được chia thành nhiều nhóm; khỉ cựu thế giới, khỉ tân thế giới và các nhóm khác (xem Phụ lục 1 để biết một số tên khoa học và tên thông thường). Những nhóm này có ý nghĩa quan trọng khi nói đến các loại bệnh mà chúng có thể mắc phải và lây truyền. Ví dụ, một trong những căn bệnh nghiêm trọng nhất mà con người có thể mắc phải từ khỉ là do virus Herpesvirus simiae (virus B, Cercopithecine herpesvirus 1) gây ra, đây là bệnh truyền nhiễm ở loài khỉ cựu thế giới thuộc chi Macaca (khỉ macaca). May mắn thay, hầu hết các loài khỉ nuôi ở đất nước này đều là loài mới và được nuôi tại đây. Quy định của liên bang cấm nhập khẩu động vật linh trưởng, ngoại trừ mục đích khoa học, giáo dục và triển lãm. Người nhập khẩu phải đăng ký với Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh và phải có giấy phép đặc biệt để nhập khẩu khỉ đuôi dài, khỉ Rhesus hoặc khỉ xanh châu Phi. Thật không may, đôi khi động vật có thể bị buôn lậu vào nước hoặc được "nhận nuôi" từ các cơ sở nghiên cứu.
CÁC BỆNH LÂY NHIỄM ĐỘNG VẬT ĐƯỢC CHỌN LỌC CÓ THỂ QUAN TÂM (xem thêm trong Phụ lục 2)
Bệnh dại
Bệnh dại ở loài linh trưởng không phải người hiếm khi được báo cáo ở quốc gia này và ngoại trừ một trường hợp luôn xảy ra ở những loài động vật mới được nhập khẩu từ các vùng lưu hành bệnh dại. Ngoại lệ duy nhất xảy ra sau khi một con chó cắn một con khỉ nuôi ở 1911 trong đợt dịch bệnh dại ở chó tại Florida. Những con khỉ macaque thả rông được đưa vào khu vực Ocala Springs của Florida, nơi bệnh dại ở gấu mèo đang lưu hành, chưa bao giờ được chẩn đoán mắc bệnh dại. Trong khoảng thời gian từ 1957 (thời điểm bắt đầu bùng phát bệnh dại ở gấu mèo tại Florida) đến 1974 , hơn 640 loài linh trưởng không phải người đã được xét nghiệm bệnh dại tại Florida.
Virus B (Cercopithecine herpesvirus 1)
Có tới 90% khỉ trưởng thành có thể mang vi-rút B; hầu hết không có triệu chứng, nhưng một số có thể có tổn thương tại chỗ ở miệng. Ở người, bệnh nhiễm trùng biểu hiện dưới dạng viêm não tủy tiến triển nhanh với tỷ lệ tử vong khoảng 70%. Hầu hết 25 trường hợp nhiễm trùng ở người được ghi chép rõ ràng đều xảy ra ở những người xử lý động vật trong phòng thí nghiệm, những người này bằng cách nào đó đã bị tiêm trực tiếp mô hoặc chất lỏng từ khỉ qua vết cắn, vết cào, kim tiêm hoặc vết thương trong phòng thí nghiệm. Mặc dù những con khỉ thế giới mới bị nhiễm bệnh thực nghiệm sẽ mắc bệnh tử vong và có thể bị nhiễm bệnh do tiếp xúc với khỉ đuôi dài, nhưng trong hầu hết các trường hợp, vết cắn của khỉ thế giới mới vào người không gây lo ngại về căn bệnh tử vong này vì nó không phải là căn bệnh đặc hữu ở loài khỉ thế giới mới. Bài báo đính kèm, Khuyến nghị về Phòng ngừa và Điều trị khi Tiếp xúc với Virus B (Cercopithecine Herpesvirus 1)(xem Phụ lục 3) được xuất bản vào tháng 11 15, 2002, trên Tạp chí Bệnh truyền nhiễm lâm sàng, cung cấp thông tin chi tiết về phòng ngừa và điều trị sau khi tiếp xúc với khỉ đuôi dài. (Truy cập trang CDC về vi-rút B để biết thêm thông tin.)
Bệnh lao (TB)
Các loài linh trưởng không phải người rất dễ bị nhiễm vi khuẩn lao (TB) và có thể bị lây từ người hoặc các động vật khác. Các loài linh trưởng sống trong môi trường có bệnh lao ở người phổ biến có nguy cơ mắc bệnh cao nhất. Trong thời gian cách ly 31 ngày đối với các loài linh trưởng nhập khẩu hợp pháp, tối thiểu phải thực hiện ba xét nghiệm da về bệnh lao và tiêu hủy những con vật có kết quả xét nghiệm dương tính. Những con khỉ nhập khẩu trái phép và những con được nuôi và bán làm thú cưng ở Hoa Kỳ có thể không được xét nghiệm đầy đủ và có thể bị nhiễm bệnh.
Nhiễm trùng vết thương tại chỗ
Khoảng 224 chủng vi khuẩn đã được xác định trong vết thương bị nhiễm nước bọt của người và động vật. Các sinh vật thường gặp nhất trong miệng khỉ Rhesus là loài Neisseria , liên cầu khuẩn tan máu alpha và Haemophilus parainfluenza. Ngoài ra, bác sĩ điều trị cần được thông báo về khả năng nhiễm trùng Eikenella corrodens, một loại vi khuẩn kỵ khí tùy ý liên quan đến vết cắn của người và động vật linh trưởng không phải người, gây tổn thương mô nghiêm trọng.
Bệnh đường ruột
Chúng lây lan qua đường phân-miệng và gây ra các triệu chứng tương tự ở người và động vật linh trưởng không phải người. Các tác nhân phổ biến nhất bao gồm vi khuẩn (Shigella, Salmonella, Campylobacter), ký sinh trùng nguyên sinh (Cryptosporidium, Giardia, Amoeba, Balantidia) và ký sinh trùng giun sán (Strongyloides).
Virus gây suy giảm miễn dịch ở khỉ (SIV)
SIV có quan hệ mật thiết với HIV-1 và HIV-2 (nguyên nhân gây ra AIDS) và gây ra căn bệnh giống AIDS ở loài khỉ đuôi dài; nó có thể không có triệu chứng ở các loài khác. Chưa có báo cáo nào về bệnh tật ở người, nhưng có những nhà nghiên cứu đã phát triển kháng thể chống lại SIV sau khi xử lý các mẫu vật trong phòng thí nghiệm.
Marburg và Ebola (Filovirus)
Con người đã mắc bệnh do nhiễm trùng Marburg khi tiếp xúc với mô của loài khỉ xanh châu Phi. Virus Ebola từ Sudan và Zaire chưa được phân lập từ khỉ. Một loại virus Ebola khác đã được phát hiện ở 1995 loài tinh tinh Tây Phi khi một nhà nghiên cứu bị nhiễm bệnh. Virus Ebola gây ra đợt bùng phát tại cơ sở kiểm dịch khỉ ở Reston, Virginia, không gây bệnh cho bất kỳ người nào, nhưng bốn người xử lý động vật đã phát triển kháng thể chống lại loại virus này. Những sự cố này nhắc nhở chúng ta về khả năng lây nhiễm các mầm bệnh chưa được phát hiện ở người thông qua loài khỉ hoang dã.
Khác
Các loài linh trưởng không phải người có nhiều khả năng mắc bệnh viêm gan A, bệnh sởi hoặc bại liệt từ con người hoặc từ một thí nghiệm trong phòng thí nghiệm hơn là truyền các bệnh này cho con người. Tuy nhiên, một khi đã nhiễm những căn bệnh này, loài linh trưởng có thể gây nguy hiểm cho con người khi tiếp xúc với chúng.